Bis heute konnten zahlreiche Auslöser für das Headshaking beim Pferd gefunden werden. Einen bildet die Trigeminus Neuralgie, also eine Entzündung des Gesichtsnervs des Pferdes. Dies geschieht zum Beispiel nach unsachgemäßem Einsatz von Knotenhalftern oder zu eng verschnallten Nasenriemen, nicht passenden Trensen oder Kappzäumen. Kiefer- und Nasenbrüche sowie die Verletzung des Nasenknorpels oder sogar Siebbeinhämatome gehören zu den Auslösern von Headshaking beim Pferd. Traumata nach Stürzen oder Tritten im Bereich des Kopfes kommen ebenfalls als Auslöser infrage. Auch allergische Reaktionen auf Futtermittel wie bestimmte Getreidesorten, Kräuter und Gräser, Pollen, Equipment und Gebisse können Headshaking beim Pferd auslösen. Auf der Weide können Pflanzen wie das Johanniskraut die Lichtempfindlichkeit verstärken und sollten vermieden werden. Der bovine Papillomavirus führt zu Sarkoiden sowie auftretender Auraler Plaque im äußeren Pferdeohr. Beide können zu Headshaking beim Pferd führen. Auch Milben, Haarlinge oder Zeckenin oder an den Ohren sind als Auslöser bekannt, genauso wie eine Mittelohrentzündung. Zahnfrakturen und Zahnschmerzen können ebenfalls ein Grund für das permanente Kopfschlagen sein, ebenso wie die periodische Augenentzündung bei Pferden. Neben der Trigeminusneuralgie ist jedoch vor allem auch eine Infektion des Luftsackes mit Bakterien oder Pilzen einer der häufigeren Gründe für Headshaking beim Pferd.